菌群检测怎么选？16s测序和宏基因组测序的区别？

一直以来，我们强调肠道健康的重要性，积极为大家普及定期做菌群检测的意义。

今天，我们继续带大家了解一下菌群检测的方法，对比一下目前常见的两种菌群检测方法：16srRNA测序与宏基因组测序。为大家在菌群检测的选择上提供有价值的参考意见。

16s rRNA测序

16s rRNA基因是原核生物的核糖体中30S亚基的组成部分（长度约为1542nt），是细菌上编码rRNA相对应的DNA序列，存在于所有细菌的基因组中。

16s rRNA测序基于分析细菌的16srRNA基因序列，可以提供菌群组成的信息。

这种方法主要用于研究肠道菌群的物种组成以及物种多样性，适用于对菌群种类进行基本了解。

宏基因组测序

宏基因组测序是指以肠道中所有微生物基因组为研究对象，对整个微生物群落的DNA进行高通量测序。

通过宏基因组测序可以获知肠道菌群丰度、菌群组成、菌群多样性、基因组成及功能、相关代谢通路等，进一步得到具有应用价值的肠道菌群信息。

16s测序与宏基因组测序的区别

16s rRNA测序的检测速度快，价格适中。这种测序方法可以识别不同的细菌群，提供一般性的物种水平信息，但无法提供详细的菌株水平信息。

该方法常可鉴别到微生物的“属水平”，常用于大规模样本处理，适合想要快速了解自身肠道菌群状态的人群。

宏基因组测序可鉴别到微生物的“种水平”，提供详细的信息：包括菌群组成、功能潜力以及菌株水平信息；

通俗而言，宏基因组测序在16s测序分析的基础上还可以进行基因和功能层面的深入研究，比如菌群生化功能的精准分析、疾病风险预测等。

由于宏基因组数据处理和分析的工序复杂，该方法耗时长且价格更加昂贵。

Q有没有通俗一点的解释？

A: 简单来说，如果把菌群检测比喻成对一本书的解读。

16s rRNA测序是全篇阅读且快速获知主要内容；而宏基因组则是逐字逐句精读、深入理解。

怎么选择菌群检测方法呢？

如果我们想要进行菌群检测，到底该选择16s测序还是宏基因组测序呢？

▲如果您想要快速获知自身肠道菌群的整体情况，可以选择16s测序。

▲若不考虑时间和价格，想要深入了解详细菌株水平信息以及疾病风险相关信息等，则可以选择宏基因组测序。

不论是16s测序还是宏基因组测序，只要能建立定期进行菌群检测的意识，对我们了解自身肠道微生态及身体状态都有极大的帮助。